卓克基土司官寨有五层，是一个四方形的结构，中间是天井，这个官寨有17代土司在这里生活，第16代土司重新修建了现在我们看到的官寨，也是最辉煌的时候。按照以前的功能分布一楼是佣人住宿和功能房间比如厨房，轿子，仓库等，二楼是会客室，客人住宿的地方，当年毛爷爷和恩来同志就住在二楼。三楼是土司和夫人的房间以及重要人士的会客室，还有议事厅，四楼和五楼是宗教人士的佛堂和住宿，结构清晰，分布合理。现在因为变成展览观光用所以很多功能都变化了以展示为主。